貯液瓶的日常維護(hù)。清潔是保持流動相貯液瓶正常使用的關(guān)鍵，使用LCMS級的溶劑和試劑。陳舊的流動相和用久了的試劑應(yīng)定期廢棄，防止生長微生物和組分改變。貯液瓶內(nèi)壁定期清洗，流動相濾頭定期清洗或更換。
　　
液相泵的日常維護(hù)。泵的密封圈是最易磨損的部件，密封圈的損壞可能引發(fā)漏液或劇烈壓力波動;單向閥的正常工作至關(guān)重要，它若發(fā)生故障，將直接影響流速的穩(wěn)定性。日常維護(hù)應(yīng)注意以下幾點(diǎn)：①使用LCMS級的溶劑和試劑；②確保系統(tǒng)壓力在正常范圍；③使用完緩沖液體系后用純水沖洗干凈，防止鹽沉積，系統(tǒng)不運(yùn)行時應(yīng)存儲在無緩沖液的溶液或有機(jī)溶劑中；④密封圈按照各個生產(chǎn)廠商的建議定期更換。進(jìn)樣器的日常維護(hù)，樣品預(yù)處理對于防止進(jìn)樣針和進(jìn)樣閥堵塞至關(guān)重要。預(yù)處理常用方法：①超濾；②溶劑萃取/去鹽；③固相萃取；④灌注凈化/去鹽；⑤色譜分離；⑥甲醇或乙腈沉淀蛋白；⑦酸水解，酶解；⑧衍生化。色譜柱的維護(hù)和保存：①每次工作結(jié)束，用高比例強(qiáng)溶劑沖洗色譜柱，沖去留在柱上的強(qiáng)吸附組分；②凈化樣品，樣品中的微粒會進(jìn)入色譜柱，在柱頭上沉積下來，造成柱壓升高，柱效降低；③避免撞擊色譜柱，如掉落或超聲震蕩；④柱壓避免急劇變化；⑤反相柱C18應(yīng)保存在純有機(jī)相或50%有機(jī)相中，一周不用要卸下，兩端用堵頭密封，避免干枯。
　　
流動相的選擇。LCMS常用的流動相為甲醇、乙腈、水和它們不同比例的混合物以及一些易揮發(fā)鹽的緩沖液，如甲酸銨、乙酸銨等，還可以加入易揮發(fā)酸堿如甲酸、乙酸或氨水等調(diào)節(jié)pH值;LCMS體系要避免使用含磷或氯的緩沖液，含鈉和鉀的成分必須<1mmol/l。(鹽分太高會抑制離子源的信號和堵塞噴霧針及污染接口)含甲酸(或乙酸)<2%，含三氟乙酸<0.5%，含三乙胺<1%，含醋酸銨<10—5 mmol/l。
　　
樣品的預(yù)處理。從保護(hù)儀器角度出發(fā)，防止固體小顆粒堵塞進(jìn)樣管道和噴霧針，防止污染MS,降低分析背景，排除對分析結(jié)果的干擾;從ESI電離得過程分析看，電荷聚集在液滴的表面，樣品和雜質(zhì)在液滴表面相互競爭，不揮發(fā)物(如磷酸鹽等)妨礙帶電液滴揮發(fā)，大量雜質(zhì)妨礙帶電樣品離子氣化，增加電荷中和的可能。
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